74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2825 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  48.94 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  45.92 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  47.32 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  43.53 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  43.1 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  51.67 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  51.31 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  44.44 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  31.17 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  28.74 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  31.03 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  31.17 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  31.17 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  33.16 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  38.63 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  36.81 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  29.87 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  31.49 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  37.17 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  34.25 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  31.46 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  29.78 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  30.74 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  31.25 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  34.81 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  31.43 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  32.4 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  29.14 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  27.35 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  35.38 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  28.09 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  32.32 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  30.86 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.29 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  32.83 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  30.27 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  33.71 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  29.17 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  28.78 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  30.04 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  27.43 
 
 		 409 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  28.85 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  22.08 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  30.27 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  28.63 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  30.59 
 
 		 621 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  29.79 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  29.83 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  27.32 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  29.33 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  26.24 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  30.57 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  27.32 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  27.93 
 
 		 471 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  33.16 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  28.76 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  28.42 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  30.18 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  31.33 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  27.47 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  32.91 
 
 		 289 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  30.72 
 
 		 227 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  29.61 
 
 		 393 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  28.45 
 
 		 288 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>