More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2824 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  67.4 
 
 
460 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  67.61 
 
 
460 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  67.83 
 
 
465 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  69.58 
 
 
460 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  69.93 
 
 
462 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
470 aa  951    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  67.61 
 
 
460 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  70.02 
 
 
460 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  67.75 
 
 
468 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  63.58 
 
 
476 aa  599  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  62.21 
 
 
487 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  56.42 
 
 
473 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  52.31 
 
 
471 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  56.33 
 
 
481 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  56.33 
 
 
481 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  55.03 
 
 
489 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  56.33 
 
 
483 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  56.33 
 
 
483 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  56.33 
 
 
483 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  56.11 
 
 
483 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  53.64 
 
 
465 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  56.11 
 
 
483 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  56.11 
 
 
481 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  52.47 
 
 
463 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.09 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  52.27 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  53.03 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.53 
 
 
462 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  52.54 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  52.26 
 
 
500 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.68 
 
 
471 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  51.88 
 
 
494 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  50.76 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  50.54 
 
 
460 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.54 
 
 
460 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 
464 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 
460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
460 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 
458 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
460 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  48.34 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  50.99 
 
 
463 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 
460 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  51.21 
 
 
482 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  51.43 
 
 
463 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 
463 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  47.36 
 
 
480 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 
457 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  44.47 
 
 
458 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.34 
 
 
461 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  46.8 
 
 
457 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 
457 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  48.84 
 
 
464 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  46.8 
 
 
457 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  46.8 
 
 
457 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 
463 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 
463 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 
463 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 
485 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 
455 aa  428  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 
457 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 
457 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 
457 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
446 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
446 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 
470 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
446 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  46.02 
 
 
446 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 
446 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
446 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  48.2 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  48.2 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  48.2 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  48.41 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  46.02 
 
 
446 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 
460 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  48.41 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  48.2 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
457 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 
455 aa  421  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
446 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  45.67 
 
 
469 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  43.81 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>