35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2823 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  67.12 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  57.89 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  48.15 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  46.24 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  42.68 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  49.44 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  44.26 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  45.1 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  42.59 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  40.74 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  43.4 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  43.4 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  39.62 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  36.67 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  42 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  39.22 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  31.75 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  39.22 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  32.84 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  35.48 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  30.43 
 
 		 75 aa  40.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>