216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2694 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  61.04 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  63.04 
 
 		 259 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  64.29 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  58.7 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  64.53 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  64.17 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  64.17 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  59.43 
 
 		 260 aa  289  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  55.22 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  45.6 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  43.78 
 
 		 252 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  41.9 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  42.23 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  41.5 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  40.56 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  38.79 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  37.45 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  35.78 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  34.57 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  36.12 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  35.68 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  35.68 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  35.68 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  35.68 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  35.68 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  35.68 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  34.01 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  32.79 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  33.06 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  34.06 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  34.06 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  34.06 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  33.62 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  34.13 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  36.11 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  33.83 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  30.88 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  34.62 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  31.32 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  27.11 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.19 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  28.51 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.74 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  28.51 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  25.1 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  28.5 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  25.81 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.05 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.2 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.74 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 487 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  34.75 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  32.28 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  32.8 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  24.44 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  28.81 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  22.47 
 
 		 283 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  23.08 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  25.64 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  23.85 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  30.16 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  25.64 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  25.64 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  30.4 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  23.08 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  30.71 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  31.36 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  33.65 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  25.89 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  26.98 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  34.21 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  24.21 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  30.25 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>