More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2687 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  69.33 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  85.48 
 
 		 233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  83.82 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  79.56 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  79.56 
 
 		 274 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  85.71 
 
 		 274 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  80.45 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  74.26 
 
 		 261 aa  215  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  78.86 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  72.52 
 
 		 250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  71.77 
 
 		 146 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  71.77 
 
 		 146 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  70.97 
 
 		 147 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  70.97 
 
 		 147 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  70.97 
 
 		 147 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  73.04 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  73.28 
 
 		 148 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  61.07 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  65.47 
 
 		 152 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  73.68 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  72.17 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  72.17 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  71.55 
 
 		 149 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  61.07 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  69.23 
 
 		 154 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  69.23 
 
 		 151 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  58.87 
 
 		 129 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  57.76 
 
 		 130 aa  151  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  49.53 
 
 		 121 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  52.04 
 
 		 117 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  50.47 
 
 		 115 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  47 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  45.87 
 
 		 119 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  45.1 
 
 		 115 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.9 
 
 		 116 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  41.53 
 
 		 156 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  41.51 
 
 		 123 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  42.31 
 
 		 114 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  33.61 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  35.29 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  37.84 
 
 		 123 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  40.95 
 
 		 140 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.18 
 
 		 118 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.1 
 
 		 135 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  41.18 
 
 		 118 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  34.91 
 
 		 143 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  45.05 
 
 		 158 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  45.05 
 
 		 139 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  45.05 
 
 		 139 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  36.94 
 
 		 150 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  33.33 
 
 		 141 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  34.21 
 
 		 148 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  34.23 
 
 		 166 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  37.36 
 
 		 149 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  37.36 
 
 		 147 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  38.24 
 
 		 122 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  37.62 
 
 		 123 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  35.51 
 
 		 109 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  35.79 
 
 		 137 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  36.45 
 
 		 120 aa  85.9  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  36.54 
 
 		 137 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  34.62 
 
 		 115 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  35.58 
 
 		 109 aa  85.1  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  34.95 
 
 		 109 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  35.24 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  34.91 
 
 		 123 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  39.56 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  34.95 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  34.95 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  40.71 
 
 		 117 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  34.95 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  34.31 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  33.33 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  38.46 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  36.54 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  33.68 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  40.66 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  34.95 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  31.53 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  39.56 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  38.78 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  33.98 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  40.86 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  40.4 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  40.4 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  40.4 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  33.01 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>