More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2625 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  72.46 
 
 		 283 aa  410  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  72.1 
 
 		 283 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  68.79 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  71.48 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2012  dihydropteroate synthase  67.59 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2610  dihydropteroate synthase  67.26 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  69.12 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  66.54 
 
 		 292 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  62.22 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1269  dihydropteroate synthase  64.23 
 
 		 278 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0477565  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  56.79 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  57.52 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  54.84 
 
 		 291 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  56.27 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  55.51 
 
 		 265 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  53.02 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  52.21 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  55.04 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  55.04 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  55.04 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  55.04 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  54.31 
 
 		 270 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  54.68 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  54.68 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  52.73 
 
 		 280 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  53.96 
 
 		 299 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  54.32 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  54.32 
 
 		 332 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  53.6 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  53.24 
 
 		 313 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  49.63 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0817  dihydropteroate synthase  53.41 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  53.41 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  48.7 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  48.38 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1187  dihydropteroate synthase  53.24 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1269  dihydropteroate synthase  53.76 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.870569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  52.38 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  47.23 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  51.47 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  48.5 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  47.73 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  48.11 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  48.11 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  48.97 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  48.51 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1737  dihydropteroate synthase  53.51 
 
 		 276 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.429553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.23 
 
 		 437 aa  231  8.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 301 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  47.67 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  47.51 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  45.83 
 
 		 282 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  46.33 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  47.25 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.65 
 
 		 280 aa  228  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.99 
 
 		 279 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  46.32 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50.58 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 		 264 aa  225  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  45.22 
 
 		 277 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  45.13 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  46.89 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  45.02 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  48.72 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  47.6 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>