More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2581 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  100 
 
 		 471 aa  954    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  62.9 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.48 
 
 		 509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.57 
 
 		 501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  65.57 
 
 		 501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.38 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.32 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.11 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.84 
 
 		 459 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  57.01 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  50.88 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  43.95 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.68 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  45.19 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  42.44 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 453 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 453 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  41.55 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 449 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  41.55 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  41.55 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  41.94 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  41.94 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  41.55 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  41.57 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  41.57 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  37.24 
 
 		 433 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  35.99 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  33.33 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  30.18 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  30.47 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  34.78 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  29.61 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  34.12 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  31.52 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.32 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  34.84 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  35.92 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  37.46 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  36.55 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  36.9 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  29.09 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  29.31 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  36.9 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  36.55 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  31.76 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.57 
 
 		 432 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.11 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  34.3 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  28.95 
 
 		 430 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.96 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.96 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.89 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  30.94 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 438 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  33.24 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  31.22 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  30.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  36.59 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  31.03 
 
 		 448 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  146  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  32.29 
 
 		 444 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  32.64 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  32.64 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  32.64 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  32.64 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  31.23 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  31.23 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  31.23 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  31.23 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  31.22 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  31.05 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  32.58 
 
 		 523 aa  144  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  31.05 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  31.05 
 
 		 439 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>