157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2398 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 363 aa  717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  71.91 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  69.91 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  70.49 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  70.39 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  65.62 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  65.77 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  56.94 
 
 		 365 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  55.83 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  56.89 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  56.01 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  56.59 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  53.52 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  52.91 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  50.99 
 
 		 410 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  52.42 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  54.88 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  54.68 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  54.79 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  54.1 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  54.1 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  52.39 
 
 		 376 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  54.1 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  54.1 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  54.1 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  54.1 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  54.1 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  44.25 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  44.25 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  39.83 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  42.16 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.37 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  43.06 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  39.89 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  40.72 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  44.01 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  42.38 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  42.06 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  41.47 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  40.18 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  40.98 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  40.98 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  40.06 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  39.77 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 338 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  40.57 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  38.72 
 
 		 338 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  39 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  40.36 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  38.82 
 
 		 324 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  41.34 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  39.29 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  40.66 
 
 		 334 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  37.39 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.82 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  30.26 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  29.78 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  28.17 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.3 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  30.61 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.33 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  29.02 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  29.8 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  29.38 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.38 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.53 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  29.88 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.18 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.04 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.07 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.5 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  25.96 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  26.21 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.18 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.92 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>