More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2394 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 729 aa  1486    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  51.45 
 
 		 711 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 719 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 710 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 710 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 712 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 743 aa  330  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 743 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 743 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 743 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 743 aa  320  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.54 
 
 		 704 aa  320  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 743 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 751 aa  311  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.09 
 
 		 724 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 724 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 702 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 698 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.97 
 
 		 705 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 708 aa  217  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 742 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 707 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 707 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 738 aa  210  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 707 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 702 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 728 aa  200  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 727 aa  194  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 710 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 811 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 726 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 811 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 728 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.68 
 
 		 737 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 742 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 718 aa  158  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 718 aa  156  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 753 aa  155  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 757 aa  154  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 772 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 772 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 708 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 805 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 726 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 730 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 768 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 774 aa  147  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 819 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 727 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 706 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 761 aa  145  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 737 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 716 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  26.18 
 
 		 746 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 756 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 729 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 753 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  26.27 
 
 		 804 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 722 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 729 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 708 aa  134  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 758 aa  134  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 710 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 768 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  24.05 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 762 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 802 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 755 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 759 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  26.23 
 
 		 804 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 734 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  23.51 
 
 		 720 aa  127  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 712 aa  127  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 701 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 757 aa  127  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 709 aa  127  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  24.09 
 
 		 703 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 761 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 764 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 808 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 724 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 722 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.6 
 
 		 711 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  25.22 
 
 		 771 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 710 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 754 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 801 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.73 
 
 		 708 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 728 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 800 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 712 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>