More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2194 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  100 
 
 		 456 aa  919    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  70 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  73.19 
 
 		 474 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  69.57 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  69.57 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  68.7 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  66.16 
 
 		 452 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  70.7 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  70.63 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  58.97 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  46.44 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  48.48 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  46.48 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  47.12 
 
 		 475 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  47.22 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  52.61 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  40.59 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  50.53 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  44.55 
 
 		 503 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  47.93 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  47.72 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  45.47 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  43.46 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  43.95 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  43.21 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  43.46 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  43.46 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  43.46 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  43.46 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  43.46 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  43.46 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  43.46 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  43.46 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  46.21 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  41.2 
 
 		 462 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  41.2 
 
 		 462 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  41.57 
 
 		 434 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  41.62 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  40.89 
 
 		 441 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  40.65 
 
 		 403 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  41.13 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  40.48 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.6 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  42.94 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  41.88 
 
 		 413 aa  262  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  37.64 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  40.37 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  40.93 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  40.93 
 
 		 393 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  38.85 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  41.62 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  39 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.41 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  41.76 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  40.64 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  40.63 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  40.38 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  38.7 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.56 
 
 		 389 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  40.38 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  34.83 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  34.83 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36.96 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  37.2 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  40.35 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.68 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  40.62 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  37.69 
 
 		 414 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.44 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  34.44 
 
 		 379 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.41 
 
 		 381 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  34.44 
 
 		 379 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  34.44 
 
 		 379 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  38.89 
 
 		 351 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  34.35 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  35.23 
 
 		 386 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  36.36 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  33.33 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.01 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  33.65 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.62 
 
 		 367 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  35.22 
 
 		 386 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  36.21 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  35.64 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.46 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  36.97 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  38.04 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  37.78 
 
 		 419 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  37.78 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  38.07 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  37.12 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  40.18 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  32.22 
 
 		 377 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  40.18 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>