More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2173 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.04 
 
 		 478 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.08 
 
 		 475 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.34 
 
 		 475 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.55 
 
 		 481 aa  757    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.08 
 
 		 475 aa  824    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  961    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.46 
 
 		 478 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.97 
 
 		 475 aa  823    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.25 
 
 		 478 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.76 
 
 		 475 aa  836    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.34 
 
 		 475 aa  834    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.18 
 
 		 484 aa  798    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.86 
 
 		 475 aa  822    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2881  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.33 
 
 		 475 aa  783    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.5 
 
 		 489 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.35 
 
 		 476 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.77 
 
 		 476 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.71 
 
 		 474 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.35 
 
 		 476 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.14 
 
 		 476 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.21 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.14 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.13 
 
 		 474 aa  618  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.92 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.5 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.92 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.29 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.29 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.37 
 
 		 476 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.29 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.31 
 
 		 478 aa  586  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.33 
 
 		 478 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.1 
 
 		 478 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0855  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.83 
 
 		 483 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.04 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.62 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.96 
 
 		 478 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.53 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.82 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.05 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.74 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.49 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2632  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.65 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.586503 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.53 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.89 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.99 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.45 
 
 		 581 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.62 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.33 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.62 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.91 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.95 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  53.63 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.63 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.49 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.42 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.49 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.22 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.14 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.42 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.42 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.21 
 
 		 478 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.34 
 
 		 478 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.43 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.64 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.04 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.43 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.22 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.97 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.5 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.33 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.38 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.79 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.59 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.99 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 467 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.56 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.29 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.35 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.84 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  51.98 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.64 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>