More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2099 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
216 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 
187 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 
196 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
187 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
187 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
187 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
187 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 
189 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  36.41 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 
191 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
187 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
205 aa  118  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
188 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
201 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
193 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
196 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  31.48 
 
 
189 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
193 aa  95.5  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
181 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
189 aa  94.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  28.57 
 
 
189 aa  92.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
191 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  28.65 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
188 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
188 aa  89  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
600 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
186 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
192 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  31.89 
 
 
187 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  29.34 
 
 
186 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.34 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  29.21 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  27.45 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 
183 aa  61.6  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 
194 aa  61.6  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  29.93 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 
196 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  27.22 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
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NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 
189 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  28.07 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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