More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2098 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1001  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  144  4e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2208  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
182 aa  139  2e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.500142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
188 aa  127  7e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003193  hypothetical protein  34.78 
 
 
181 aa  112  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  40 
 
 
168 aa  72.4  2e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
177 aa  71.2  5e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
178 aa  68.6  4e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  27.48 
 
 
186 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
182 aa  62.8  2e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  38.38 
 
 
182 aa  62  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
186 aa  60.5  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
171 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
175 aa  59.7  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2470  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.95 
 
 
130 aa  59.7  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000909286  normal  0.30524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  39.05 
 
 
177 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  38.1 
 
 
177 aa  58.9  3e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.64759e-07  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2497  acetyltransferase  25.6 
 
 
180 aa  58.5  4e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000399882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2566  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
198 aa  57.8  6e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0688428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2771  acetyltransferase, GNAT family  25.6 
 
 
180 aa  57.4  7e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0074365 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2764  acetyltransferase  25.6 
 
 
180 aa  57.4  7e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.824722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2577  acetyltransferase  25.6 
 
 
180 aa  57.4  7e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.95975e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2818  acetyltransferase, GNAT family  24.8 
 
 
180 aa  57.4  8e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2533  acetyltransferase  25.6 
 
 
180 aa  56.6  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.93156e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
168 aa  55.5  3e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1002  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
169 aa  54.7  5e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
182 aa  54.3  7e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2797  acetyltransferase  24.55 
 
 
180 aa  54.3  8e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00286655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2518  acetyltransferase, GNAT family  24 
 
 
198 aa  53.9  8e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0162592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4189  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
169 aa  53.9  9e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248105  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2246  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
168 aa  53.9  9e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.886105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  36.19 
 
 
167 aa  53.9  9e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1117  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
169 aa  53.9  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2775  acetyltransferase, GNAT family  24 
 
 
198 aa  53.9  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0999  acetyltransferase  27.27 
 
 
169 aa  53.5  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1163  acetyltransferase, GNAT family  27.27 
 
 
169 aa  53.9  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
169 aa  53.5  1e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
176 aa  53.5  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
175 aa  53.1  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.160145 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09204  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14730)  34.12 
 
 
197 aa  52.8  2e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4547  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513868  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
181 aa  52.4  3e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
182 aa  52.4  3e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0208114  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  52  3e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
178 aa  52  4e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
178 aa  52  4e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
166 aa  51.2  5e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0512  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
253 aa  51.2  6e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  28.71 
 
 
165 aa  51.2  7e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  32.14 
 
 
162 aa  50.8  8e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0695  hypothetical protein  27.37 
 
 
168 aa  50.4  9e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.107584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0680  hypothetical protein  27.37 
 
 
168 aa  50.4  9e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
182 aa  50.1  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0704  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
291 aa  50.1  1e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001236  histone acetyltransferase HPA2  27.36 
 
 
166 aa  50.1  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.993571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
179 aa  50.1  1e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.52 
 
 
147 aa  50.4  1e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 
163 aa  50.1  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  28 
 
 
165 aa  50.1  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.5157e-05  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  28.71 
 
 
168 aa  49.7  2e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.78 
 
 
157 aa  49.7  2e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
158 aa  49.3  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  34.45 
 
 
169 aa  49.7  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  28.71 
 
 
168 aa  49.7  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1203  acetyltransferase  26.26 
 
 
161 aa  49.3  2e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.79076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2943  acetyltransferase, GNAT family  30.84 
 
 
166 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0987554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  28.71 
 
 
165 aa  49.7  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
178 aa  49.7  2e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1798  GCN5-related N-acetyltransferase  23.21 
 
 
181 aa  49.7  2e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.82 
 
 
148 aa  49.7  2e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  28 
 
 
165 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2657  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
176 aa  48.9  3e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0130376  normal  0.0628799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
182 aa  48.9  3e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
194 aa  48.9  3e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
179 aa  48.9  3e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2932  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
182 aa  48.9  3e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0153421 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  28.72 
 
 
169 aa  48.5  4e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1059  acetyltransferase  23.3 
 
 
185 aa  48.5  4e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0205734  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0743  acetyltransferase  32.56 
 
 
167 aa  48.5  4e-05  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.267097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2168  acetyltransferase, GNAT family  27.72 
 
 
165 aa  48.5  4e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  40.24 
 
 
141 aa  48.1  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
166 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  33.9 
 
 
187 aa  48.1  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
166 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.37 
 
 
150 aa  48.1  5e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  33.9 
 
 
187 aa  48.1  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>