202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2005 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  60.24 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  59.34 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  58.85 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  58.43 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  56.79 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  57.38 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  58.2 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  56.79 
 
 		 256 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  56.3 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  55.34 
 
 		 252 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  56.54 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  56.12 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  55.42 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  54.58 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  57.49 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  57.49 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  55.65 
 
 		 242 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.57 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.67 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.77 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  36.56 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  29.07 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  31.88 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.15 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  30.85 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.65 
 
 		 968 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  30.68 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.73 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.36 
 
 		 692 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.84 
 
 		 653 aa  52  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 868 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0703  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.81 
 
 		 621 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.23 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  30.28 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  29.31 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.14 
 
 		 451 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  26.54 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  29.31 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  28.2 
 
 		 490 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  33.01 
 
 		 876 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 		 652 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.46 
 
 		 596 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.33 
 
 		 402 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28.33 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.86 
 
 		 735 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  29.41 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.12 
 
 		 701 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  34.88 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  26.4 
 
 		 453 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  29.76 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  31.45 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  31.45 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.84 
 
 		 680 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.39 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  24.27 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  32.56 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  31.58 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.03 
 
 		 557 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  29.18 
 
 		 593 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  30.69 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  30.11 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  35.23 
 
 		 417 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  21.1 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  25 
 
 		 649 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.32 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  28.19 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.63 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  33.72 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  33.72 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.88 
 
 		 606 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  30.56 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.17 
 
 		 653 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.58 
 
 		 634 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  35.29 
 
 		 467 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  31.03 
 
 		 300 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  30.53 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  30.65 
 
 		 339 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.49 
 
 		 688 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  24.27 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  29.79 
 
 		 674 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  28.47 
 
 		 1010 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>