255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2002 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  42.31 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  38.2 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  37.85 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  37.85 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  37.85 
 
 		 179 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  37.85 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  37.85 
 
 		 179 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  37.64 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  37.64 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  37.64 
 
 		 179 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.49 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  28.81 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  35.79 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  35.79 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  35.79 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  25.44 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  24.49 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.58 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  27.34 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  28.05 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  28.05 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  27.89 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  28.05 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  28.05 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.92 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  24.26 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.48 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  27.44 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  27.42 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  27.92 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.17 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  27.89 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  27.49 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  28.76 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>