More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1928 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  73.44 
 
 
192 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  70.1 
 
 
194 aa  293  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  69.43 
 
 
194 aa  289  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  75.14 
 
 
189 aa  286  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  72.68 
 
 
193 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  70.21 
 
 
193 aa  285  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  69.68 
 
 
193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  67.71 
 
 
215 aa  278  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  68.23 
 
 
194 aa  277  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  65.41 
 
 
196 aa  249  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  56.91 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.29 
 
 
190 aa  234  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.37 
 
 
194 aa  227  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.32 
 
 
193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.92 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.79 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  57.59 
 
 
207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.51 
 
 
192 aa  217  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  54.4 
 
 
191 aa  217  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  59.02 
 
 
192 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  59.67 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  60.37 
 
 
187 aa  215  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.74 
 
 
203 aa  215  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.37 
 
 
207 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  49.21 
 
 
192 aa  205  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  50.28 
 
 
194 aa  201  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  53.41 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  64.38 
 
 
197 aa  195  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  49.73 
 
 
517 aa  194  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  49.2 
 
 
517 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.35 
 
 
214 aa  189  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.07 
 
 
192 aa  188  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  51.85 
 
 
189 aa  171  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  53.16 
 
 
182 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  50.28 
 
 
202 aa  169  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  46.82 
 
 
191 aa  168  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  51.61 
 
 
182 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  47.4 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  43.39 
 
 
203 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  51.92 
 
 
197 aa  157  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  45.9 
 
 
186 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  46.06 
 
 
182 aa  147  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.33 
 
 
196 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  38.81 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  42.07 
 
 
201 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  43.4 
 
 
317 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  39.18 
 
 
310 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.68 
 
 
316 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  41.76 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  39.8 
 
 
206 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  43.75 
 
 
304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  42.94 
 
 
315 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  37.13 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  41.14 
 
 
309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  43.15 
 
 
171 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.3 
 
 
198 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  37.7 
 
 
198 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  40 
 
 
153 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  42.76 
 
 
313 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  34.62 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  42.14 
 
 
312 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  38.16 
 
 
221 aa  97.8  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  42.75 
 
 
166 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.1 
 
 
168 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  36 
 
 
240 aa  94.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.76 
 
 
168 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.13 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  32.88 
 
 
175 aa  88.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.66 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  33.99 
 
 
251 aa  88.2  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.24 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  32.17 
 
 
175 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  35.67 
 
 
159 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  34.97 
 
 
251 aa  85.1  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  34.9 
 
 
160 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  32.48 
 
 
207 aa  84.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
254 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  34.64 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  35.97 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  30.92 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  36.57 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.84 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.95 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  33.55 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  34.01 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.66 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  33.75 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  30.99 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  38.82 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  35.86 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  39.46 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  37.69 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  33.56 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>