More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1841 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  81.52 
 
 		 395 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  86.08 
 
 		 395 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  100 
 
 		 394 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  82.28 
 
 		 395 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  83.97 
 
 		 398 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  78.37 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  71.83 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  70.44 
 
 		 421 aa  567  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  71.83 
 
 		 394 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  71.57 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  70.81 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 394 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  67.68 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  66.84 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  66.58 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  67.86 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  66.33 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  68.21 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  66.33 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  65.31 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  65.05 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  65.05 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  66.84 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  65.31 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  66.16 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  66.58 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  65.05 
 
 		 394 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  65.05 
 
 		 394 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  64.8 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  66.16 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  65.9 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  65.05 
 
 		 394 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  66.33 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  66.33 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  66.16 
 
 		 394 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  66.16 
 
 		 394 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  64.72 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  65.14 
 
 		 395 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  63.17 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  64.62 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  64.36 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  65.82 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  62.15 
 
 		 398 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  62.4 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  60.93 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  64.1 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  62.69 
 
 		 393 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  61.79 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  63.59 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  58.27 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  63.08 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  59.03 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  59.08 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  60.76 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  59.74 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  58.57 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  59.39 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  61.18 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  58.82 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  56.71 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  52.91 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  53.21 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  50.89 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  52.79 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  52.96 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>