More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1760 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 376 aa  761    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  62.3 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  60.43 
 
 		 390 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  62.57 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  56.99 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  51.55 
 
 		 410 aa  362  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  47.43 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  47.43 
 
 		 389 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  44.12 
 
 		 397 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  44.12 
 
 		 397 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  44.12 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  44.12 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  44.12 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  44.12 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  45.68 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  45.45 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  43.32 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  42.82 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  43.13 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  45.91 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  43.52 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.44 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  45.4 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  42.49 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  42.49 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  41.07 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  45.43 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  42.02 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  41.13 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  41.39 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  43.01 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  41.49 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  41.11 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  39.3 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  37.86 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.57 
 
 		 379 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  38.29 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  37 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  38.13 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  39.57 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  38.67 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  37.69 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  35.42 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  37.6 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  36.64 
 
 		 344 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  35.9 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  37.5 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  37.88 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  33.95 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  34.22 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  51.95 
 
 		 180 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  41.56 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  34.07 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  36.63 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  40.78 
 
 		 231 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 325 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  31.82 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  37.02 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  36.4 
 
 		 231 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  39.07 
 
 		 183 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  33.65 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  42 
 
 		 190 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  34.52 
 
 		 199 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  34.83 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 		 199 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0328  HPP family protein+B94  51.52 
 
 		 134 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00996185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  31.86 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  34.53 
 
 		 164 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  40.62 
 
 		 182 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  36.88 
 
 		 189 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  40.62 
 
 		 182 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  40.62 
 
 		 182 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  40.62 
 
 		 182 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  37.96 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  37.65 
 
 		 179 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  39.84 
 
 		 182 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  39.84 
 
 		 182 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 180 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  40.62 
 
 		 182 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  34.91 
 
 		 185 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  32.54 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.33 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  38.41 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  34.68 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  41.26 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  34.73 
 
 		 181 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  36.48 
 
 		 178 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>