More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1758 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  77.48 
 
 		 329 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  69.44 
 
 		 330 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  66.98 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  59.88 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  61.3 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  57.14 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  51.53 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  51.23 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.64 
 
 		 341 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.93 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.52 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.54 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.55 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.48 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.61 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.06 
 
 		 335 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  41.41 
 
 		 332 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  40.82 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.75 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  42.07 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.64 
 
 		 358 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.07 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.14 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.89 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.92 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.2 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.78 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.54 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.22 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.43 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.48 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.82 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.29 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.5 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.72 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.49 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.54 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.09 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  38.98 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.13 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.21 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.97 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.51 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  41.96 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.81 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.97 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.25 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.41 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.5 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.81 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.85 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.42 
 
 		 328 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  39.69 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.96 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  39.74 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.64 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.18 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.57 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.42 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.18 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  39.72 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.7 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.94 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.94 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.67 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  39 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  38.8 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.8 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  39.01 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  39.25 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.34 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.29 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.93 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.2 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.69 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.34 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.82 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  40.07 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.13 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.65 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.28 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  38.85 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2751  hypothetical protein  39.73 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37.35 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  39.39 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.45 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  40.5 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>