93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1754 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  69.77 
 
 		 486 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  71.48 
 
 		 395 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  71.48 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  71.48 
 
 		 395 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  71.48 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  71.48 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  72.76 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  71.48 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  64.88 
 
 		 293 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  61.87 
 
 		 295 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  65 
 
 		 294 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  61.54 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  61.54 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  67.39 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  64.81 
 
 		 291 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  64.49 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  64.49 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  63.85 
 
 		 293 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  68.03 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  63.18 
 
 		 293 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  67.29 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  59.15 
 
 		 291 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  59.34 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  58.89 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  58.89 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  58.15 
 
 		 303 aa  331  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  59.12 
 
 		 292 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  56.41 
 
 		 287 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  51.57 
 
 		 299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  51.22 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50.87 
 
 		 299 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  52.75 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  52.75 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  52.75 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  51.22 
 
 		 299 aa  305  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  52.38 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  51.28 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  49.67 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  49.63 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  46.28 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  41.89 
 
 		 292 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  39.24 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.91 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  35.69 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  36.5 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  35.64 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  32.94 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  21.57 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  25.64 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 246 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 		 526 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  22.03 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.82 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.74 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  26.97 
 
 		 261 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 597 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  24.6 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.74 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.24 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.23 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 318 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  22.58 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  24.41 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>