More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1719 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  60.62 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  54.95 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  54.63 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  54.63 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  53.7 
 
 		 326 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  55.31 
 
 		 350 aa  348  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  52.04 
 
 		 322 aa  325  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  56.25 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  44.87 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  35.79 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  35.07 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  34.66 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  31.82 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  35.06 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  33.02 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  35.93 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  35.66 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  33.56 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  33.96 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  33.9 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.82 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  34.92 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.68 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  32.88 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  30.57 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.21 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  34.4 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  37.72 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.02 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  31.86 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  36.57 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  37.37 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  36.45 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.12 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  38.52 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.68 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.88 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  32.75 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  34.9 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.13 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  33.66 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  32.43 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  36.33 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  37.64 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  31.86 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.68 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.85 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  33.96 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  35.57 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.57 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.08 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  31.08 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  38.21 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  32.01 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.1 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  35.54 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  30.46 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  32.43 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4135  hypothetical protein  34.75 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118225  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.81 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.43 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.61 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  34.19 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  31.52 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.55 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  35.96 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  31.53 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  34.83 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  31.23 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  31.86 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.33 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  34.06 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  31.8 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  32.8 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.39 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.25 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.07 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.63 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  33.22 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  33.01 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.2 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.2 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  31.87 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  30.82 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.02 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  32.7 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  29.62 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>