More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1717 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  79.88 
 
 		 331 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  68.44 
 
 		 334 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  67.26 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  65.67 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  51.67 
 
 		 333 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  50.47 
 
 		 332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.16 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.73 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.73 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.99 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.53 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.97 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.2 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.41 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.6 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  45.72 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.88 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.15 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.38 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.37 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.64 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  45.16 
 
 		 338 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.64 
 
 		 349 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.77 
 
 		 339 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.36 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  48.16 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.45 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.36 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.56 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  45.03 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.6 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  41.09 
 
 		 325 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.38 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.92 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.24 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.81 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.81 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  45.81 
 
 		 343 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  45.3 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.74 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.76 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.54 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.92 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.35 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.27 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  45.02 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.25 
 
 		 339 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.4 
 
 		 336 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  43.6 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.87 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  44.41 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.08 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.14 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.03 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  44.08 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  44.3 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.24 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.79 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.14 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.23 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.23 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.75 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.89 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.48 
 
 		 386 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  42.42 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.99 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.04 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.87 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  42.04 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.85 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.52 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  42.99 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.25 
 
 		 326 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.67 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.53 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.34 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  43.38 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.81 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  41.23 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  40.18 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.79 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 		 331 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.84 
 
 		 330 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.91 
 
 		 358 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  43.71 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  43.61 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.79 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.86 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.23 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.41 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  40.3 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.58 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  42.05 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  38.25 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.99 
 
 		 325 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>