More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1599 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 340 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  75.64 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  69.02 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  66.57 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  63.86 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  62.06 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  56.68 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  56.68 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  57.57 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  56.89 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  56.97 
 
 		 339 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  54.93 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  54.12 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  56.64 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  56.64 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.85 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  52.94 
 
 		 340 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  55.92 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  55.33 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  55.33 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  60 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  55.62 
 
 		 341 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  55.33 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  55.33 
 
 		 341 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  55.33 
 
 		 341 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  55.03 
 
 		 342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  53.61 
 
 		 343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  53.61 
 
 		 343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  57.37 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  53.44 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  54.68 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  55.72 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  54.03 
 
 		 312 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  51.88 
 
 		 329 aa  318  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  50.6 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  48.94 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  49.69 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  52.31 
 
 		 340 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  46.15 
 
 		 319 aa  305  9.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  50.78 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  50.77 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  50.61 
 
 		 342 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  50.15 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  49.65 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  39.08 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  41.46 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  38.34 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.34 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  38.96 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  40.12 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  40.18 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  38.91 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  39.51 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.34 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  38.34 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  37.96 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  40.57 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  37.28 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  35.96 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  38.94 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  39.55 
 
 		 316 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  36.62 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  39.87 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  39.55 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  37.15 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  36.47 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  36.01 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  36.19 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  34.23 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  34.68 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  35.47 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  34.02 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  35.69 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  35.38 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.38 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  33.14 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  33.04 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  47.02 
 
 		 225 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  29.13 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  36.57 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  34.26 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  34.26 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  34.65 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  34.26 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  32.56 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  35.45 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  33.24 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.58 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.03 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  32.78 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  36.39 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  32.69 
 
 		 385 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  31.59 
 
 		 397 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  33.7 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  32.6 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  38.42 
 
 		 231 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  31.93 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.27 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>