More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1451 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 311 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  89.03 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  85.71 
 
 		 309 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  87.42 
 
 		 302 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  84.26 
 
 		 309 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  82.62 
 
 		 310 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  80.98 
 
 		 305 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  80.98 
 
 		 305 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  77.56 
 
 		 320 aa  524  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  77.88 
 
 		 320 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  80.2 
 
 		 306 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  73.6 
 
 		 306 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  73.51 
 
 		 308 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  71.85 
 
 		 305 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 309 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 309 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  72.61 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 309 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 309 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  70.59 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  70.92 
 
 		 560 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  70.92 
 
 		 309 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  70.59 
 
 		 309 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  69.93 
 
 		 309 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  71.38 
 
 		 308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  70.72 
 
 		 308 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  70.72 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  69.71 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  68.2 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  68.21 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  68.2 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 		 300 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  59.73 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  58.61 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 300 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  55.67 
 
 		 304 aa  362  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  56.23 
 
 		 298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 		 302 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  56.33 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  56.33 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  56.9 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 306 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 		 312 aa  346  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 306 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.75 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  55.22 
 
 		 306 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 306 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  53.51 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 305 aa  338  5e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  53.2 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 306 aa  332  4e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  51.85 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 315 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 312 aa  308  9e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 308 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 303 aa  299  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 		 316 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 307 aa  298  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 312 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>