264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1406 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  79.84 
 
 		 130 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  74.62 
 
 		 130 aa  213  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  74.42 
 
 		 132 aa  207  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.32 
 
 		 130 aa  203  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.32 
 
 		 130 aa  203  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  70.54 
 
 		 543 aa  199  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.22 
 
 		 131 aa  195  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.31 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.19 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.14 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.06 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.06 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.48 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.06 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.48 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.49 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.97 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.97 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.18 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.94 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.06 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.06 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.59 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.85 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.65 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.96 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.96 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.7 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  38.28 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.59 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.74 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.7 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.23 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.74 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.18 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.96 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.75 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 133 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.97 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  42.97 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.52 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.74 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.48 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.22 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 		 127 aa  91.3  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.03 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.06 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.1 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.64 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>