51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1365 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  739    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  67.19 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  67.36 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  71.16 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  68.88 
 
 		 388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  67.63 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  59.84 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  67.55 
 
 		 388 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  60.37 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  67.29 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  66.58 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  70.53 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  62.07 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  54.45 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  60.26 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  68.52 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  54.57 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  52.33 
 
 		 388 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  51.97 
 
 		 382 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  49.62 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  52.32 
 
 		 401 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  51.8 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  49.62 
 
 		 428 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  51.81 
 
 		 401 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  53.33 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  49.11 
 
 		 426 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  49.12 
 
 		 437 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  47.99 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  52.8 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  54.37 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  52.56 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  41.08 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  36.75 
 
 		 398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  37.56 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  38.32 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  34.16 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  34.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  38.61 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  36.92 
 
 		 407 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  41.52 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  34.16 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  41.21 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  30.17 
 
 		 392 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  29.44 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  31.12 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  29.49 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  27.9 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.89 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  24.2 
 
 		 245 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>