More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1279 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 423 aa  854    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  79.01 
 
 		 425 aa  678    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  72.34 
 
 		 470 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  76.36 
 
 		 423 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  76.54 
 
 		 429 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  79.67 
 
 		 424 aa  690    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  79.01 
 
 		 425 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  75.83 
 
 		 417 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  73.7 
 
 		 417 aa  624  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  64.64 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  66.75 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  57.01 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  57.01 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.29 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  56.53 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  56.77 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  56.53 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  56.29 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  56.77 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  56.53 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  56.77 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.29 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  56.53 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.06 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  56.53 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  56.06 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.06 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.34 
 
 		 419 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.06 
 
 		 421 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  57.62 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  57.62 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  55.95 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  56.17 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  57.14 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  54.82 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.94 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  53.15 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  51.53 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  50.24 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  49.39 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  52.03 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.32 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.18 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.46 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.01 
 
 		 433 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  36.65 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39.86 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  39.28 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  40.09 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.24 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  39.15 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.06 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.02 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.88 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  38 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  37.21 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.11 
 
 		 432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  37.53 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  37.7 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  36.18 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  36.51 
 
 		 432 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  36.94 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.27 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  36.41 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.73 
 
 		 459 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  40.89 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  31.88 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  37 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.05 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  41.42 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  37.62 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.12 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  37.53 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  32.02 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  38.73 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.39 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.08 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.55 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.81 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  40.32 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.01 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  37 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  37 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  37 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  37 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  33.86 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  36.68 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.73 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  37.04 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.79 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  33.86 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  35.04 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.24 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  33.8 
 
 		 448 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.93 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  35.64 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  39.32 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.98 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.46 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>