More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1226 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 		 681 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.08 
 
 		 690 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.19 
 
 		 681 aa  727    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.51 
 
 		 684 aa  1002    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.02 
 
 		 690 aa  751    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.29 
 
 		 683 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 686 aa  1377    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.21 
 
 		 683 aa  996    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  84.43 
 
 		 682 aa  1147    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.83 
 
 		 684 aa  1011    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.19 
 
 		 685 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.75 
 
 		 686 aa  774    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 675 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.63 
 
 		 681 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.52 
 
 		 678 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.12 
 
 		 686 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.67 
 
 		 678 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 		 679 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 691 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  68.92 
 
 		 684 aa  947    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 686 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 		 695 aa  744    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 		 687 aa  691    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.58 
 
 		 676 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 		 681 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 		 678 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.65 
 
 		 684 aa  1004    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.85 
 
 		 678 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.92 
 
 		 679 aa  785    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 		 681 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.73 
 
 		 686 aa  709    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.92 
 
 		 683 aa  712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.01 
 
 		 675 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.4 
 
 		 674 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  50.29 
 
 		 836 aa  618  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 		 683 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.66 
 
 		 664 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.37 
 
 		 702 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 		 703 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.57 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.39 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  45.24 
 
 		 517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  46.03 
 
 		 519 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  45.74 
 
 		 516 aa  353  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 		 523 aa  346  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 		 520 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  43.23 
 
 		 515 aa  140  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  30.1 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  29.69 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  29.77 
 
 		 476 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  29.1 
 
 		 476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 		 477 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  27.8 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  30.47 
 
 		 488 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  45.93 
 
 		 148 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  27.75 
 
 		 478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.02 
 
 		 517 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  30.84 
 
 		 477 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  29.88 
 
 		 798 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  25.77 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  31.25 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.5 
 
 		 472 aa  107  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  43.33 
 
 		 153 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.99 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  26.03 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  24.9 
 
 		 496 aa  106  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  27.17 
 
 		 510 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 		 485 aa  106  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  24.95 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  24.95 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  25.43 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  25.48 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.31 
 
 		 487 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.8 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.32 
 
 		 499 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.74 
 
 		 477 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  42.07 
 
 		 146 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  26.85 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.52 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  27.83 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.74 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  29.06 
 
 		 496 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  42.86 
 
 		 148 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  26.86 
 
 		 474 aa  102  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  30.55 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.08 
 
 		 491 aa  101  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  27.42 
 
 		 479 aa  101  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  26.85 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  41.38 
 
 		 146 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  25.96 
 
 		 788 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 		 683 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  28.93 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  28.93 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  39.73 
 
 		 147 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>