163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1222 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  78.97 
 
 		 205 aa  321  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  76.8 
 
 		 202 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  69.9 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  57.14 
 
 		 208 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.15 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.14 
 
 		 192 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.21 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  59.57 
 
 		 189 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  54.17 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  56.48 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  55.44 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  52.55 
 
 		 194 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  55.9 
 
 		 196 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  55.9 
 
 		 196 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  54.97 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  55.38 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  47.67 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.67 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  48.08 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  48.73 
 
 		 194 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.97 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  54.55 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  54.69 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  54.69 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  54.69 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  53.89 
 
 		 192 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  52.94 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 		 189 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 		 189 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  49.47 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.47 
 
 		 189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  48.95 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  51.34 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  47.15 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.08 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  33.51 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.16 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  33.68 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.03 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  33.68 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  34.59 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.69 
 
 		 176 aa  101  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  33.15 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.79 
 
 		 180 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  31.38 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.93 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.85 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  45.92 
 
 		 118 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.96 
 
 		 186 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 180 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  29.26 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  32.8 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  28.34 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.47 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  30.21 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.79 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.78 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  29.03 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  32.64 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.39 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  28.87 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.68 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.45 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.56 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.03 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.31 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  32.45 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  32.54 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  23.94 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  23.94 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  32.39 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  26.35 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  33.33 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.29 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>