More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1162 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  100 
 
 		 80 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  87.01 
 
 		 82 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  78.95 
 
 		 82 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  78.95 
 
 		 82 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  77.92 
 
 		 82 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  74.03 
 
 		 81 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  77.33 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  77.63 
 
 		 82 aa  123  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  68.83 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  67.11 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  65.79 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  66.22 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  66.22 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  66.22 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  63.51 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  62.16 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  62.16 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  62.16 
 
 		 79 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  60.81 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  58.11 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  56 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  59.15 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  53.25 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  48.05 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  49.35 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  51.95 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  48.65 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  47.5 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  43.37 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  49.35 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  42.67 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  42.67 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  43.59 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  44 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  39.76 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  39.76 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  36.84 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  39.74 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  38.75 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  37.66 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  46.67 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  36.84 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  44.74 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  45.33 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  46.05 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  50.88 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  50.88 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  46.67 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  38.67 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  44 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  42.86 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  34.62 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  35 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  59.57 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  44.44 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  35.53 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  40.79 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  35.53 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  43.59 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  43.59 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  42.67 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.89 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  32.89 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  41.33 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  42.67 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  32.89 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  32.89 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  32.89 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  32.89 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  32.89 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  44 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  42.31 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  42.67 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  31.58 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  31.58 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  32.89 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  32.89 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  41.03 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  38.46 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0506  BolA family protein  34.25 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  39.19 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>