125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1132 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  49.71 
 
 		 700 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  49.72 
 
 		 733 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  48.51 
 
 		 718 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  47.75 
 
 		 738 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  47.14 
 
 		 719 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  65.05 
 
 		 739 aa  983    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  46.28 
 
 		 740 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  51.75 
 
 		 750 aa  702    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  47.89 
 
 		 737 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  48.03 
 
 		 740 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  47.89 
 
 		 737 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  67.08 
 
 		 732 aa  971    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  64.75 
 
 		 742 aa  956    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  66.12 
 
 		 717 aa  950    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  48.51 
 
 		 718 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  62.03 
 
 		 724 aa  918    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  59.8 
 
 		 679 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  48.51 
 
 		 718 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  48.88 
 
 		 725 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  48.51 
 
 		 718 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  48.88 
 
 		 725 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  50.28 
 
 		 734 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  64.76 
 
 		 727 aa  935    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  48.88 
 
 		 738 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  66.12 
 
 		 717 aa  950    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  47.89 
 
 		 737 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  48.03 
 
 		 738 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  47.57 
 
 		 741 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  46.56 
 
 		 737 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  50.9 
 
 		 734 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  100 
 
 		 722 aa  1476    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  41.39 
 
 		 670 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  42.05 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  39.91 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  35.12 
 
 		 679 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  33.19 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  32.6 
 
 		 700 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  31.71 
 
 		 701 aa  335  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  31.46 
 
 		 664 aa  323  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  32.8 
 
 		 614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  32.8 
 
 		 614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  24.42 
 
 		 457 aa  101  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.07 
 
 		 429 aa  87.8  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  24.93 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.73 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.55 
 
 		 428 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  25.15 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  25.15 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  26.27 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.91 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.78 
 
 		 426 aa  77.4  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.48 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.55 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  21.82 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.16 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  24.66 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.61 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  26.28 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.78 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  24.23 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25.08 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  25.51 
 
 		 461 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  24.52 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.69 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  25.92 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  21.62 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  24.62 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.12 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  20.83 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  24.19 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  25.66 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.18 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  21.57 
 
 		 458 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  30.59 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  23.27 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  25.8 
 
 		 569 aa  60.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  24.7 
 
 		 550 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  25.31 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  24.92 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  24.84 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  28.4 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  28.4 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  28.39 
 
 		 749 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  43.75 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  25.47 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  30.58 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.68 
 
 		 554 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  45.16 
 
 		 1045 aa  55.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  24.6 
 
 		 553 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  25.15 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  23.85 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  24.77 
 
 		 434 aa  51.2  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.17 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  41.43 
 
 		 1041 aa  50.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  36.59 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  36.59 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  36.59 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  20.06 
 
 		 542 aa  49.3  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  25.36 
 
 		 529 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.02 
 
 		 548 aa  48.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>