More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1126 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  90.59 
 
 		 403 aa  733    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  83.46 
 
 		 396 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 393 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  84.99 
 
 		 387 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  93.89 
 
 		 393 aa  755    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  94.91 
 
 		 393 aa  757    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  94.66 
 
 		 393 aa  756    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  90.1 
 
 		 393 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  93.44 
 
 		 393 aa  746    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  83.72 
 
 		 387 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  91.88 
 
 		 393 aa  741    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  82.95 
 
 		 396 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  92.88 
 
 		 393 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  83.97 
 
 		 396 aa  661    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  90.89 
 
 		 395 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  93.88 
 
 		 393 aa  764    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  80.2 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  80.2 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  80.2 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  80.2 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  79.95 
 
 		 407 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  79.7 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  79.64 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  79.13 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  79.13 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  79.7 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  78.93 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  78.57 
 
 		 387 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  78.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  73.6 
 
 		 388 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1719  S-adenosylmethionine synthetase  78.17 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.950197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2003  S-adenosylmethionine synthetase  78.68 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  76.05 
 
 		 387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  74.37 
 
 		 389 aa  567  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  74.37 
 
 		 389 aa  567  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  70.66 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 		 387 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  67.51 
 
 		 389 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 		 382 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 		 385 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  68.38 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 		 403 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  66.58 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  68.38 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  67.87 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 		 385 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  67.87 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  67.87 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 		 384 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  64.8 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  65.23 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  64.54 
 
 		 389 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  64.97 
 
 		 393 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 383 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 381 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  63.87 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 383 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  65.81 
 
 		 383 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 383 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  63.78 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 383 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  65.3 
 
 		 383 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  65.62 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 388 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  65.81 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  64.03 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  67.87 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  65.3 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3707  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 383 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00568587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  67.61 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>