More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1099 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  100 
 
 		 349 aa  700    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  53.3 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  53.03 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  53.76 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  53.28 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 353 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  51.15 
 
 		 353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  50.29 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  54.71 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  52.6 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  51.8 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  50.8 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  50.81 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  49.27 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  48.69 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  47.01 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  50.32 
 
 		 351 aa  298  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  52.9 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  44.6 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  44.6 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.2 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  43.84 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  43.84 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  47.96 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  44.32 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.35 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  44.21 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  46.13 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  45.65 
 
 		 364 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.66 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  41.92 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.86 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  48.12 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.9 
 
 		 350 aa  270  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  44.96 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.14 
 
 		 359 aa  268  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  51.14 
 
 		 348 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  51.14 
 
 		 348 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.08 
 
 		 363 aa  268  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  51.14 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  43.85 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  47.95 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  44.48 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  43.5 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.91 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  42.47 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.3 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  42.03 
 
 		 363 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  47.76 
 
 		 342 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 		 379 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.43 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  40.55 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  42.06 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  46.37 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  43.1 
 
 		 356 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.33 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.22 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  42.68 
 
 		 348 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.09 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  46.58 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  44.29 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  47.06 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  47.99 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.32 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  55.23 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  43.52 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  55.08 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  47.28 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  47.28 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.86 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  47.28 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  47.02 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  55.23 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  50.56 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  42.25 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  42.98 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.77 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  45.56 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.61 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>