More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0874 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  68.37 
 
 		 562 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  68.84 
 
 		 550 aa  766    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  66.61 
 
 		 568 aa  726    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 557 aa  1127    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  63.19 
 
 		 556 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  68.28 
 
 		 556 aa  727    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  70.18 
 
 		 544 aa  757    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  66.61 
 
 		 568 aa  727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  70 
 
 		 559 aa  746    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  39.18 
 
 		 566 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 545 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  38.36 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  37.58 
 
 		 306 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 		 301 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 303 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  37.63 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 304 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 302 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 		 302 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 316 aa  146  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  39.15 
 
 		 310 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 		 310 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 		 313 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  37.05 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 317 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 		 303 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  34.97 
 
 		 278 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 		 301 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 		 306 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.46 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  29.45 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 302 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 304 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  37.97 
 
 		 303 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 288 aa  134  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 307 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 		 288 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  38.49 
 
 		 264 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  34.05 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  35.49 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  39.44 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 273 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  35.02 
 
 		 294 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  33.56 
 
 		 301 aa  124  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 310 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 263 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 310 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 285 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  32.51 
 
 		 305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 275 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.93 
 
 		 259 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  40.48 
 
 		 267 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  34.43 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  37.72 
 
 		 310 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 264 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 268 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  32.18 
 
 		 308 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 296 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 254 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  30.79 
 
 		 304 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.86 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  34.89 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 259 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 264 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  31.84 
 
 		 264 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 276 aa  106  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 		 275 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  35.91 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  36.4 
 
 		 264 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 260 aa  104  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 268 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 266 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 255 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 		 247 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 270 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 257 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 267 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 257 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 		 340 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 272 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 		 283 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>