More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0823 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.81 
 
 
623 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  100 
 
 
625 aa  1268    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  65.44 
 
 
592 aa  802    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  73.38 
 
 
608 aa  854    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  75.93 
 
 
621 aa  902    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.97 
 
 
623 aa  756    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  61.67 
 
 
623 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  61.29 
 
 
605 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  64.15 
 
 
629 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  63.15 
 
 
624 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  53.86 
 
 
606 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  58.27 
 
 
622 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  54.41 
 
 
646 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  61.97 
 
 
654 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  61.41 
 
 
607 aa  769    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  62.28 
 
 
623 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.97 
 
 
623 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  63.93 
 
 
612 aa  801    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  58.12 
 
 
606 aa  687    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.97 
 
 
651 aa  761    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.97 
 
 
623 aa  756    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  61.67 
 
 
629 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  77.26 
 
 
608 aa  907    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  71.64 
 
 
637 aa  835    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  76.7 
 
 
619 aa  908    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.97 
 
 
623 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  62.85 
 
 
656 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  61.97 
 
 
631 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  63.77 
 
 
612 aa  800    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  62.76 
 
 
630 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  61.97 
 
 
623 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
593 aa  721    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  61.97 
 
 
623 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  61.51 
 
 
623 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  61.97 
 
 
623 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  61.83 
 
 
623 aa  758    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  68.81 
 
 
619 aa  804    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.81 
 
 
623 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  63.05 
 
 
607 aa  783    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  71.45 
 
 
603 aa  873    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  71.64 
 
 
590 aa  848    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  77.11 
 
 
621 aa  907    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  71.29 
 
 
603 aa  851    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
603 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  53.83 
 
 
612 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 
589 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  51.04 
 
 
617 aa  628  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  53.85 
 
 
612 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  53.52 
 
 
606 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  52.92 
 
 
596 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  52.92 
 
 
596 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  52.92 
 
 
631 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  54.74 
 
 
615 aa  628  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  53.23 
 
 
597 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  52.26 
 
 
607 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  51.45 
 
 
652 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  50.48 
 
 
655 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.34 
 
 
602 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  53.28 
 
 
595 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  52.99 
 
 
624 aa  611  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  51.61 
 
 
655 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  52.58 
 
 
651 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  52.09 
 
 
598 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 
596 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  51 
 
 
598 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  50.4 
 
 
609 aa  608  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  53.24 
 
 
610 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  52.09 
 
 
594 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  51.93 
 
 
596 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  52.27 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  52.59 
 
 
647 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  49.68 
 
 
672 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.08 
 
 
628 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  50.17 
 
 
597 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 
591 aa  599  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  52.15 
 
 
654 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  51.83 
 
 
644 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  51.65 
 
 
663 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  50.66 
 
 
598 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  50.08 
 
 
591 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  50.66 
 
 
598 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  50.73 
 
 
652 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  50.66 
 
 
598 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  51.74 
 
 
662 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  50.5 
 
 
598 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  49.92 
 
 
628 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  51.08 
 
 
661 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  49.76 
 
 
651 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  49.49 
 
 
598 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  49.76 
 
 
657 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  50.72 
 
 
672 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.42 
 
 
628 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  50.17 
 
 
590 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  50.34 
 
 
577 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.17 
 
 
627 aa  592  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  51.25 
 
 
625 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  50.92 
 
 
625 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  50.08 
 
 
991 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.34 
 
 
625 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  51.55 
 
 
604 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>