More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0774 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 1476 aa  3008    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  44.38 
 
 		 953 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  41.03 
 
 		 988 aa  249  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 		 1152 aa  244  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 1334 aa  241  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  42.01 
 
 		 1084 aa  236  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 		 1236 aa  235  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  47.33 
 
 		 329 aa  233  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  43.15 
 
 		 253 aa  233  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  47.48 
 
 		 956 aa  229  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  41.7 
 
 		 1119 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  50.87 
 
 		 219 aa  198  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  50.87 
 
 		 219 aa  198  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  50.87 
 
 		 219 aa  198  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  50.87 
 
 		 219 aa  198  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  49.71 
 
 		 219 aa  196  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  50.29 
 
 		 219 aa  196  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  50.29 
 
 		 219 aa  193  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  49.71 
 
 		 219 aa  190  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  48.55 
 
 		 219 aa  190  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  37.83 
 
 		 518 aa  189  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  49.71 
 
 		 219 aa  189  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 305 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  44.04 
 
 		 223 aa  179  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01361  hypothetical protein  40.08 
 
 		 273 aa  162  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 		 994 aa  155  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 828 aa  154  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 673 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 334 aa  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 384 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 		 322 aa  119  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 1303 aa  116  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 268 aa  116  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 1177 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 1177 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 1032 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 740 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 740 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 261 aa  110  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 1301 aa  108  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.11 
 
 		 2401 aa  107  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 323 aa  105  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 260 aa  104  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 253 aa  103  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 278 aa  102  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  29.21 
 
 		 1147 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 336 aa  101  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  45.19 
 
 		 746 aa  93.2  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 924 aa  92.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 293 aa  91.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 1220 aa  89.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  26.83 
 
 		 272 aa  87.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  46.24 
 
 		 849 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 322 aa  87  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 983 aa  85.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.84 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 773 aa  85.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 660 aa  84  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  29.2 
 
 		 1608 aa  83.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 930 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 		 369 aa  83.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 544 aa  83.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.52 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  35.92 
 
 		 181 aa  82.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 812 aa  82  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 1271 aa  82  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 738 aa  81.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 366 aa  81.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 1265 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 250 aa  81.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 		 777 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 352 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 		 665 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 305 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 398 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 338 aa  80.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 228 aa  80.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 277 aa  80.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 361 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  34.91 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 280 aa  79.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  37.16 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 1292 aa  79.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 663 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  33.04 
 
 		 323 aa  78.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  54.79 
 
 		 1806 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  30.89 
 
 		 295 aa  77.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 347 aa  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  54.79 
 
 		 1632 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  28.7 
 
 		 391 aa  77  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  37.19 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 872 aa  76.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 274 aa  76.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>