More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0745 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 416 aa  838    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  78.4 
 
 		 398 aa  597  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  76.62 
 
 		 406 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  77.14 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  74.54 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  74.54 
 
 		 426 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 450 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  66.43 
 
 		 420 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 426 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  62.4 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  57.07 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  53.75 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  55.39 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  53.55 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  53.55 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  52.63 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  51.24 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  52.14 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  51.49 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  51.49 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  52.14 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  52.19 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  52.14 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  52.14 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  52.14 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  52.19 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  51.79 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  52.14 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  52.14 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  52.14 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  47.49 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  48.97 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  46.98 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  40.71 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  42.89 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.77 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 441 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  38.29 
 
 		 446 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 441 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.05 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.01 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  43.22 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.25 
 
 		 395 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  40.05 
 
 		 440 aa  279  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.66 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 438 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  40.36 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 399 aa  276  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  38.13 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  41.6 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  40.7 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  37.86 
 
 		 439 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 400 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 393 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 438 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.26 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  38.21 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  45.31 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.34 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.99 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  40.35 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>