More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0717 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
641 aa  1290    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 
639 aa  555  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 
657 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 
657 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
539 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
845 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
526 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
776 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 
528 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
528 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 
529 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
530 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
530 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
1084 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
662 aa  359  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
642 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
642 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
651 aa  346  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
643 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
776 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
776 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
653 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
650 aa  324  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
810 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
639 aa  320  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  35.38 
 
 
678 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
938 aa  317  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
815 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
660 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
835 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
1261 aa  309  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  48.03 
 
 
547 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
807 aa  308  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  35.66 
 
 
699 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
781 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
789 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
789 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 
1287 aa  300  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 
784 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
630 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  34.16 
 
 
650 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.67 
 
 
1384 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1185 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
652 aa  294  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
660 aa  293  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
789 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.04 
 
 
1303 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.61 
 
 
1408 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
538 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
652 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 
764 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.26 
 
 
1152 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
761 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
761 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  35.26 
 
 
1015 aa  287  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
866 aa  286  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.88 
 
 
1535 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 
760 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
782 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 
816 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.76 
 
 
1361 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.16 
 
 
1371 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  35.63 
 
 
746 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  34.98 
 
 
779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  34.68 
 
 
682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.47 
 
 
1698 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  46.59 
 
 
755 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
664 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
783 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  35.88 
 
 
659 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1223 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
869 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.01 
 
 
1218 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.24 
 
 
730 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.6 
 
 
1348 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
906 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
930 aa  264  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  43.82 
 
 
742 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.61 
 
 
1380 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.05 
 
 
702 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
1088 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
755 aa  257  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
844 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  43.83 
 
 
537 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.87 
 
 
1759 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  38.96 
 
 
1222 aa  252  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
659 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.66 
 
 
752 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  44.91 
 
 
512 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  41.43 
 
 
518 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  44.56 
 
 
551 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.32 
 
 
702 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1331 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
844 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  46.09 
 
 
512 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1406 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  44.54 
 
 
741 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
738 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>