More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0661 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.38 
 
 		 205 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  76.85 
 
 		 203 aa  304  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  73.4 
 
 		 203 aa  303  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  73.4 
 
 		 203 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.92 
 
 		 203 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.43 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.4 
 
 		 205 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  72.41 
 
 		 203 aa  297  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  71.43 
 
 		 205 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.41 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.94 
 
 		 205 aa  291  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  68.97 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.46 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  69.61 
 
 		 206 aa  278  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  69.95 
 
 		 208 aa  278  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.5 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  67.98 
 
 		 203 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.02 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.18 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  64.18 
 
 		 209 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.18 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  64.53 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  61.69 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  62.07 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.08 
 
 		 221 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.59 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  60.59 
 
 		 214 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.59 
 
 		 214 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.59 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.59 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  60.5 
 
 		 266 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  60 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  60 
 
 		 300 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  60.5 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  60.5 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  58.05 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  60 
 
 		 214 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  55.12 
 
 		 219 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  57.64 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  52.71 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  49.25 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  52.48 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  50.74 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  55.78 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  47.67 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  47.67 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.78 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  44.27 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  43.98 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.67 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  44.56 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.85 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  43.98 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  43.52 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  37.44 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.71 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  39.6 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.21 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  38.73 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  38.02 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  34.3 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  38.24 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  34.88 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  37.25 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  35.82 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  35.32 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  35.32 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  35.07 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  36.41 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  34.31 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  36.82 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  30.24 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  36.82 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  36.36 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  35.82 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  36.27 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  31.22 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  32.69 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  35.86 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  35.18 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.6 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  36.6 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  34.87 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  36.46 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32.18 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>