More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0575 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  81.03 
 
 
194 aa  324  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3605  anthranilate synthase component II  80.41 
 
 
208 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.240756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  78.87 
 
 
190 aa  314  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  78.76 
 
 
190 aa  314  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  78.24 
 
 
190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  78.35 
 
 
190 aa  309  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1211  anthranilate synthase component II  74.23 
 
 
190 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  72.16 
 
 
195 aa  285  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  69.63 
 
 
189 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3878  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  70.68 
 
 
188 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  68.59 
 
 
205 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  68.23 
 
 
195 aa  272  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  69.63 
 
 
189 aa  270  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3462  anthranilate synthase, component II  68.75 
 
 
189 aa  268  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772396  normal  0.100457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  65.45 
 
 
189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  67.54 
 
 
188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  65.97 
 
 
189 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  64.92 
 
 
189 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2699  anthranilate synthase component II  63.35 
 
 
195 aa  261  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  66.15 
 
 
190 aa  261  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.97 
 
 
188 aa  261  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
200 aa  258  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  64.92 
 
 
188 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  62.3 
 
 
200 aa  257  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  63.35 
 
 
196 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  63.87 
 
 
196 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3557  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  254  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
199 aa  253  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
199 aa  253  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2572  anthranilate synthase component II  62.3 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0505  anthranilate synthase component II  62.3 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.624854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0533  anthranilate synthase component II  62.3 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3584  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0532  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  65.82 
 
 
197 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1911  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0941  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  64.8 
 
 
198 aa  251  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
195 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  63.78 
 
 
197 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  63.45 
 
 
192 aa  248  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  64.29 
 
 
197 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  64.29 
 
 
201 aa  247  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  64.4 
 
 
188 aa  247  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  63.54 
 
 
189 aa  247  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  63.78 
 
 
197 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  63.78 
 
 
197 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  63.27 
 
 
197 aa  245  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  60.61 
 
 
202 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  64.29 
 
 
201 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.24 
 
 
202 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.26 
 
 
190 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  61.26 
 
 
190 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  62.76 
 
 
199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  62.83 
 
 
195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  62.3 
 
 
189 aa  244  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  61.98 
 
 
189 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  62.5 
 
 
190 aa  244  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  61.46 
 
 
189 aa  244  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0597  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.14 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  60.94 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  61.42 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  61.22 
 
 
192 aa  242  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.2 
 
 
191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.39 
 
 
197 aa  240  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  61.73 
 
 
199 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.71 
 
 
192 aa  239  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  61.26 
 
 
191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.62 
 
 
197 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  60.91 
 
 
192 aa  237  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  60.42 
 
 
191 aa  236  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.67 
 
 
197 aa  235  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.16 
 
 
193 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.59 
 
 
192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  54.45 
 
 
195 aa  234  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.21 
 
 
193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  57.51 
 
 
204 aa  232  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0054  para-aminobenzoate synthase component II  57.51 
 
 
216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  57.36 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  53.93 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  54.64 
 
 
192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.59 
 
 
188 aa  231  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  57.59 
 
 
187 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.54 
 
 
188 aa  231  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5029  anthranilate synthase, component II  58.88 
 
 
195 aa  231  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  57.95 
 
 
238 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  53.93 
 
 
195 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  59.18 
 
 
195 aa  231  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  53.4 
 
 
195 aa  230  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.18 
 
 
193 aa  230  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.07 
 
 
187 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  57.07 
 
 
187 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0180  anthranilate synthase component II  57.87 
 
 
194 aa  229  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.223965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  57.07 
 
 
187 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0101  anthranilate synthase component II  59.07 
 
 
201 aa  230  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.134219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  57.07 
 
 
187 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.07 
 
 
200 aa  230  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>