More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0558 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  100 
 
 		 332 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  72.78 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  66.46 
 
 		 328 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  69.14 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  67.31 
 
 		 327 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  65.52 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  57.75 
 
 		 331 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  58.54 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  59.45 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  56.78 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  54.52 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  58.96 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  55 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  37.14 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  42.97 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  37.54 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  37.13 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.11 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  33.54 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  35.31 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  37.19 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  32.19 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.06 
 
 		 333 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  34.27 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  32.19 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  31.87 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  30.94 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  36.12 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  35.84 
 
 		 486 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  35.27 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  35.98 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  35.41 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  33.49 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  29.44 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  36.11 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  29.5 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  31.03 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36.95 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.21 
 
 		 716 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  29.06 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.43 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  35.21 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.85 
 
 		 599 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  26.6 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.99 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  31.95 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.84 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.42 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  27.66 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  29.44 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.37 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.36 
 
 		 731 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  32.37 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.6 
 
 		 717 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  26.02 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  32 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.08 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  37.61 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  30.23 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  25.41 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  31.85 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  29.95 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  29.9 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  30.57 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  30.4 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  30.69 
 
 		 389 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  26.67 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  27.44 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  27.34 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  38.98 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  32.37 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  25.98 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  26.47 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.67 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.39 
 
 		 715 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  28.19 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.69 
 
 		 779 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  34 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  26.99 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.08 
 
 		 601 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  29.29 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  28.63 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>