More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0532 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 870 aa  1744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  34.61 
 
 		 866 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.76 
 
 		 844 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 881 aa  356  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 825 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  31.12 
 
 		 846 aa  353  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 825 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 825 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 825 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 825 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  33.41 
 
 		 862 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  33.41 
 
 		 825 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  34.14 
 
 		 872 aa  341  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  31.09 
 
 		 886 aa  332  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 949 aa  283  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 976 aa  255  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.6 
 
 		 449 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35 
 
 		 381 aa  128  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.46 
 
 		 336 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.46 
 
 		 336 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.35 
 
 		 309 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.38 
 
 		 448 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 		 349 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 576 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 862 aa  111  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 521 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.35 
 
 		 389 aa  108  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 880 aa  108  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  33.02 
 
 		 880 aa  107  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1191 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 354 aa  105  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 		 872 aa  105  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 333 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 607 aa  104  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 		 515 aa  104  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  32.67 
 
 		 285 aa  104  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.86 
 
 		 319 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.99 
 
 		 343 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.99 
 
 		 343 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.34 
 
 		 401 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 354 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.34 
 
 		 401 aa  101  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 493 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  32.44 
 
 		 354 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.23 
 
 		 351 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.95 
 
 		 412 aa  100  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  23.39 
 
 		 635 aa  99.8  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.13 
 
 		 286 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 		 320 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 		 332 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.63 
 
 		 493 aa  100  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  35.21 
 
 		 776 aa  99  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.22 
 
 		 340 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.88 
 
 		 348 aa  99.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 		 440 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 		 408 aa  97.8  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 412 aa  97.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  33.45 
 
 		 419 aa  95.9  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 483 aa  95.5  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 294 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  36.15 
 
 		 311 aa  94.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  31.23 
 
 		 354 aa  94  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  31.23 
 
 		 354 aa  94  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 877 aa  94  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  31.23 
 
 		 354 aa  94  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 420 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  38.29 
 
 		 452 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 		 485 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.46 
 
 		 264 aa  92.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  27.22 
 
 		 734 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.12 
 
 		 241 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  33.21 
 
 		 268 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.03 
 
 		 14916 aa  91.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  30.93 
 
 		 354 aa  90.9  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.25 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.25 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.34 
 
 		 447 aa  90.1  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  31.52 
 
 		 363 aa  90.1  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  40.13 
 
 		 222 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  31.28 
 
 		 366 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.32 
 
 		 291 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 447 aa  89.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  31.32 
 
 		 291 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  38.81 
 
 		 299 aa  89  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 		 727 aa  88.2  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 		 227 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.61 
 
 		 450 aa  87.4  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  32.32 
 
 		 392 aa  87.4  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 		 355 aa  87.4  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.43 
 
 		 295 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 		 359 aa  87.4  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  30.94 
 
 		 267 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 184 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>