170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0493 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  100 
 
 		 131 aa  273  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  67.65 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  66.94 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  68.55 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  60 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  61.65 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  63.11 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  59.26 
 
 		 135 aa  166  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  54.07 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  56.41 
 
 		 124 aa  143  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  55.56 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  56.41 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  56.41 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  54.76 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  55.56 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  54.46 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  54.7 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  54.7 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  54.7 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  56.03 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  54.7 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  54.7 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  54.24 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  54.24 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  54.7 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  53.85 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  52.38 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  56.36 
 
 		 185 aa  136  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  55.36 
 
 		 211 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  55.36 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  56.36 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  56.36 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  56.36 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  52.38 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  52.99 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  52.99 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  55.17 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  54.31 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  51.59 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  54.39 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  49.21 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  55.36 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  50.93 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  52.14 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  56.03 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  53.51 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  52.68 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  54.46 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  53.51 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  53.51 
 
 		 130 aa  127  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  53.51 
 
 		 130 aa  127  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  50.43 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  51.61 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  51.79 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  46.83 
 
 		 130 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  49.57 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  49.12 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  49.21 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  50 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  49.12 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  49.12 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  49.12 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  49.12 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  50.86 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  50 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  50 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  46.92 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  46.83 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  49.56 
 
 		 130 aa  121  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  50 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  49.11 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  50 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  49.11 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  49.14 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  49.56 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  46.49 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  48.25 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  47.37 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  53.1 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  47.37 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  47.37 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  48.31 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>