More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0465 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  86.45 
 
 		 268 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  80.83 
 
 		 265 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  83.87 
 
 		 263 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  83.6 
 
 		 262 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  82.73 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  81.12 
 
 		 264 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  80 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  77.11 
 
 		 268 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  81.93 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  81.93 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  74.7 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  74.3 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  73.9 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  74.3 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  73.9 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  73.49 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  73.9 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  70.88 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  74.3 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  70.88 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  73.9 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  73.09 
 
 		 262 aa  367  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  72.41 
 
 		 263 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  74.3 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  74.3 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  72.69 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  73.09 
 
 		 266 aa  361  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  69.53 
 
 		 255 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  71.26 
 
 		 255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  67.98 
 
 		 244 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  66.67 
 
 		 268 aa  335  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  69.48 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  63.05 
 
 		 240 aa  325  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  63.05 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  63.16 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.92 
 
 		 241 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.51 
 
 		 241 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  59.11 
 
 		 241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  61.54 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.92 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  58.3 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  61.54 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  61.54 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  61.54 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  61.54 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  60.31 
 
 		 283 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  59.04 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  61.13 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  61.13 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  61.13 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 246 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  61.13 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  59.84 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  60.62 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.11 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.11 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.11 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  61.04 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.11 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.11 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  59.77 
 
 		 263 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  61.57 
 
 		 282 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  59.85 
 
 		 290 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.7 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  59.51 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.43 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  60.87 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  61.36 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  58.27 
 
 		 256 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  60.32 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.51 
 
 		 336 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.5 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  59.04 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  59.51 
 
 		 317 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  59.51 
 
 		 333 aa  295  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  60.24 
 
 		 270 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  61.51 
 
 		 267 aa  295  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  59.84 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  57.94 
 
 		 246 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.68 
 
 		 241 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  59.92 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  60.49 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  58.69 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.89 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>