219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0427 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  51.79 
 
 		 631 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  55.01 
 
 		 641 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  77.22 
 
 		 622 aa  979    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  51.63 
 
 		 631 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  55.21 
 
 		 630 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  51.63 
 
 		 621 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  53.58 
 
 		 626 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  50.89 
 
 		 636 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  55.5 
 
 		 640 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  53.12 
 
 		 624 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  57.26 
 
 		 632 aa  723    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  100 
 
 		 639 aa  1288    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  77.06 
 
 		 622 aa  989    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  53.97 
 
 		 625 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  54.35 
 
 		 641 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  78.68 
 
 		 622 aa  1018    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  52.01 
 
 		 656 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  77.02 
 
 		 627 aa  981    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  53.17 
 
 		 650 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  78.35 
 
 		 622 aa  1000    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  79.32 
 
 		 622 aa  1031    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  77.22 
 
 		 622 aa  979    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  80.45 
 
 		 622 aa  1016    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  69.61 
 
 		 628 aa  889    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  66.61 
 
 		 628 aa  859    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  50.4 
 
 		 620 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  52.82 
 
 		 632 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  48.12 
 
 		 647 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  51.75 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  51.29 
 
 		 637 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  51.11 
 
 		 638 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  51.29 
 
 		 628 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  53.61 
 
 		 634 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  51.13 
 
 		 638 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  50.64 
 
 		 630 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  50.48 
 
 		 660 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  50.79 
 
 		 688 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  51.13 
 
 		 637 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  50.79 
 
 		 638 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  50.79 
 
 		 638 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  50.73 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  50.64 
 
 		 630 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  50.64 
 
 		 630 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  50.48 
 
 		 630 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  50.48 
 
 		 630 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  50.72 
 
 		 622 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  50.32 
 
 		 660 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  50.81 
 
 		 628 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  49.52 
 
 		 620 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  49.84 
 
 		 620 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  50.32 
 
 		 634 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  53.31 
 
 		 634 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  50.24 
 
 		 634 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  50.65 
 
 		 620 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  52.43 
 
 		 614 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4015  K potassium transporter  52.99 
 
 		 632 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.035438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  53.06 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  50 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  48.87 
 
 		 637 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  48.87 
 
 		 637 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  53.26 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  50.25 
 
 		 647 aa  599  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  49.42 
 
 		 633 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  50.08 
 
 		 644 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  49.52 
 
 		 633 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1200  Kup system potassium uptake protein  52.83 
 
 		 636 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  51.62 
 
 		 613 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  50.4 
 
 		 631 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  48.72 
 
 		 643 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  50.32 
 
 		 653 aa  591  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  50.4 
 
 		 631 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  50.41 
 
 		 644 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  50.65 
 
 		 631 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  48.01 
 
 		 622 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  49.43 
 
 		 620 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1229  K+ potassium transporter  52.5 
 
 		 636 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136519  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  48.01 
 
 		 622 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  48.39 
 
 		 622 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  47.94 
 
 		 622 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  48.29 
 
 		 648 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  49.6 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  47.78 
 
 		 622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  48.54 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  47.38 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  47.85 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  47.67 
 
 		 658 aa  579  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  47.72 
 
 		 633 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  48.1 
 
 		 622 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  49.35 
 
 		 656 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  47.94 
 
 		 622 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  49.05 
 
 		 641 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  51.06 
 
 		 670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  50.56 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  50 
 
 		 663 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>