More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0382 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0382  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2376  hypothetical protein  84.81 
 
 		 237 aa  417  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3561  hypothetical protein  86.5 
 
 		 237 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2928  hypothetical protein  84.81 
 
 		 237 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3677  hypothetical protein  73.42 
 
 		 234 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1700  hypothetical protein  74.89 
 
 		 234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3178  hypothetical protein  72.57 
 
 		 233 aa  347  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.235776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18190  hypothetical protein  72.46 
 
 		 232 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3517  hypothetical protein  71.06 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000201859  normal  0.326196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3366  hypothetical protein  71.06 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699657  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3028  hypothetical protein  71.73 
 
 		 234 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.154556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2550  hypothetical protein  69.79 
 
 		 237 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  decreased coverage  0.00627186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3165  hypothetical protein  69.79 
 
 		 237 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2221  hypothetical protein  71.06 
 
 		 236 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3162  hypothetical protein  71.31 
 
 		 234 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0308091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3172  hypothetical protein  44.9 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  41.25 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  41.77 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  44.3 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  45.45 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.4 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  45.66 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  43.04 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  45.21 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  45.21 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  45.21 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  44.39 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  44.55 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.45 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  43.46 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  41.95 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  44.84 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  44.84 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  39 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  41.95 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  41.03 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  39.83 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  39.82 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  44.59 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  42.37 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  42.62 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  43.95 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  37.24 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  41.28 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  40.64 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  44 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  41.1 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  37.92 
 
 		 250 aa  148  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  41.28 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  43.46 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  43.5 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  40.25 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  41.77 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  43.81 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  40.83 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  40.91 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  41.77 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  45.74 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  43.5 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  43.05 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  41.7 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  39.01 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  43.04 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  41.28 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  38.98 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  45.7 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  36.63 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  40.93 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  38.24 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  38.72 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  35.66 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  39.41 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  40.93 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  40.93 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  40.93 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  38.84 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  39.15 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  41.52 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  40.93 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  41.91 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  41.91 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  42.22 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  37.66 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  39.46 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  38.4 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  38.98 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  39.5 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  40.83 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  41.26 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  35.96 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  41.91 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  41.28 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  38.14 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  41.91 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  40.93 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  38.98 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  39.5 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>