More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0376 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  48.95 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1023  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.4 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2362  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.67 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.48 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1740  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000284043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.19 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  34.62 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.03 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.21 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  29.05 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>