More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0316 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 447 aa  859    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  72.69 
 
 		 453 aa  627  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  71.3 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  71.3 
 
 		 456 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  71.17 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  76.52 
 
 		 445 aa  599  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  72.62 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  70.68 
 
 		 450 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  71.14 
 
 		 450 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  69.91 
 
 		 444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  69.84 
 
 		 456 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  70.05 
 
 		 447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  72.97 
 
 		 452 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  72.41 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  69.44 
 
 		 453 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  66.97 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  65.45 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.78 
 
 		 450 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  63.38 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  66.44 
 
 		 451 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  63.27 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  59.23 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  50.33 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  46.99 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  50 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.56 
 
 		 467 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.33 
 
 		 473 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  49.56 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  47.56 
 
 		 466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.77 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  50.9 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.55 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  49.12 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.99 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.68 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50 
 
 		 467 aa  339  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.45 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.55 
 
 		 469 aa  332  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  47.29 
 
 		 462 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.4 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  46.97 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  47.78 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  50.13 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  45.77 
 
 		 463 aa  316  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.74 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  45.47 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.96 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  45.79 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.07 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  45.87 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  45.87 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  42 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  46.49 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  39.81 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  43.14 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  43.68 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  40.4 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  43.54 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  41.84 
 
 		 417 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.65 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.52 
 
 		 472 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.92 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  35.56 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.34 
 
 		 392 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30.63 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  32.13 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.88 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.62 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.03 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.26 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.26 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.82 
 
 		 394 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.69 
 
 		 396 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  30.96 
 
 		 389 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.54 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.47 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.16 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.62 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.32 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  28.2 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.4 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.87 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30.51 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.66 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.56 
 
 		 392 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  32.57 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.07 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  29.74 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  30.63 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  29.75 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  29.6 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  29.75 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  29.75 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.43 
 
 		 420 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.68 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.26 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  32.13 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.14 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.75 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>