248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0292 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
319 aa  658  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  82.45 
 
 
319 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.47099e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  75.7 
 
 
321 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  77.04 
 
 
321 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  76.49 
 
 
318 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  75.86 
 
 
318 aa  504  1e-142  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  72.05 
 
 
332 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  63.41 
 
 
317 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  64.35 
 
 
321 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  61.32 
 
 
319 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  61.01 
 
 
319 aa  405  1e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  60.19 
 
 
319 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  59.75 
 
 
319 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  60.19 
 
 
319 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  60.19 
 
 
319 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  58.81 
 
 
319 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  59.56 
 
 
319 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  58.44 
 
 
339 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  58.81 
 
 
319 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  58.75 
 
 
339 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  59.25 
 
 
319 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  59.25 
 
 
319 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  58.44 
 
 
336 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  58.18 
 
 
319 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  55.7 
 
 
316 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  56.01 
 
 
318 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  55.7 
 
 
317 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  55.38 
 
 
316 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  54.43 
 
 
317 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  54.86 
 
 
335 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  54.86 
 
 
335 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  53 
 
 
318 aa  355  4e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  52.28 
 
 
329 aa  352  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  48.89 
 
 
316 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  49.37 
 
 
316 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  61.96 
 
 
264 aa  331  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  48.73 
 
 
316 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  50.16 
 
 
321 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  47.02 
 
 
320 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.08 
 
 
319 aa  286  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  47.96 
 
 
319 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 
320 aa  285  6e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  44.97 
 
 
319 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  43.08 
 
 
322 aa  243  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.27 
 
 
298 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
299 aa  111  2e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
302 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.33 
 
 
323 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
332 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
312 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
321 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.16 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.43 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  36.65 
 
 
310 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.22 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  28.52 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  77.55 
 
 
49 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.91 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.53 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
304 aa  85.1  1e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
272 aa  85.1  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
591 aa  83.6  4e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  26.53 
 
 
637 aa  83.6  4e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
287 aa  83.2  5e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  28.57 
 
 
362 aa  83.2  5e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  25.5 
 
 
309 aa  82.8  8e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 
292 aa  81.3  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
271 aa  79.7  6e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
313 aa  78.2  2e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
300 aa  77.4  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
300 aa  77.4  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
315 aa  77.4  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  27.15 
 
 
325 aa  76.6  5e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.19 
 
 
329 aa  76.3  6e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
271 aa  76.3  6e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
351 aa  75.9  9e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.69 
 
 
438 aa  75.9  9e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 
310 aa  75.9  9e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 
310 aa  75.5  1e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
315 aa  75.5  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
330 aa  75.5  1e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  24.18 
 
 
382 aa  74.3  2e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 
310 aa  75.1  2e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.29 
 
 
312 aa  74.7  2e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
314 aa  74.7  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
319 aa  74.3  3e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  26.24 
 
 
367 aa  74.3  3e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.60179e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>