252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0232 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 318 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  56.41 
 
 		 296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  55 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  50.99 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  50.18 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  37.83 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  38.46 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  37.41 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  40.62 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.21 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.97 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  35.92 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  30.18 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.18 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.03 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  30.03 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  28.93 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  31.23 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 283 aa  89.7  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.45 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  31.87 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.82 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.79 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.53 
 
 		 322 aa  85.9  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  28.23 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  26.67 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  33.8 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.02 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  26.82 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.49 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.49 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.49 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.49 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  25.93 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  26.17 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.77 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  26.15 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  25.16 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  27.09 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  25.93 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.26 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.85 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  29.12 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.43 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.43 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  25.7 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  28.11 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  28.92 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  25.46 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  28.62 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  27.7 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  31.63 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  26.32 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  26.09 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.18 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  27.65 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  29.5 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  24.37 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  23.87 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  25.63 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  22.07 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  25.81 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  25.81 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  31.16 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  25.97 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  27.08 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  26.86 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  25.45 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  25 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>